نظرسنجی نشان می دهد که اکثر توسعه دهندگان زیستی کد می نویسند و از یادگیری ماشینی استفاده می کنند. مهندسی پروتئین یک اولویت است

Cradle، پلتفرمی که به دانشمندان در طراحی و برنامه‌ریزی پروتئین‌ها کمک می‌کند، امروز یافته‌های اولین نظرسنجی BioDeveloper خود را منتشر کرد و روش‌ها و اولویت‌های توسعه‌دهندگان زیستی را برای ایجاد تصویری از روندها در بخش زیست‌شناسی مصنوعی بررسی کرد. این نظرسنجی از بیش از 150 توسعه‌دهنده زیستی مورد نظرسنجی قرار گرفت و با مشارکت Bits in Bio، یک جامعه جهانی متمرکز بر ساخت نرم‌افزار برای علم، انجام شد.

یافته های کلیدی این نظرسنجی عبارتند از:

کدنویسی در حال حاضر یک مهارت اصلی برای زیست شناسان است – و عمدتاً خودآموز است

• اکنون کدنویسی یک مهارت ضروری برای کسانی است که در بیوتکنولوژی کار می کنند. بیش از 8 نفر از 10 پاسخ دهندگان دانشمند آزمایشگاه مرطوب (87٪) اکنون کد می نویسند – با 55٪ از پاسخ دهندگان اسکریپت هایی برای خودکارسازی گردش کار به صورت هفتگی و 39٪ برنامه نویسی مهندسی داده یا خطوط لوله به صورت هفتگی.
• اکثریت گزارش می دهند که مهارت های کدنویسی آنها به صورت خودآموز است. سه چهارم (74٪) از تمام پاسخ دهندگان از طریق انجام کار یاد گرفته اند، که 63٪ از طریق مدرسه یا تحصیل یاد گرفته اند.
• پایتون رایج ترین زبان برنامه نویسی بود با 97٪ از پاسخ دهندگان از آن در 12 ماه گذشته برای انجام تجزیه و تحلیل داده ها استفاده کردند. Shell (Bash/Powershell) متداول ترین زبان برنامه نویسی بعدی (استفاده شده توسط 62٪) و پس از آن R (53٪)، SQL (41٪) و HTML/CSS (13٪) بود.

اکثریت توسعه دهندگان زیستی در حال حاضر از یادگیری ماشینی استفاده می کنند

• یادگیری ماشین اکنون یک ابزار جا افتاده در زیست شناسی است. تقریباً سه چهارم (73٪) از توسعه دهندگان زیستی گفتند که در حال حاضر از یادگیری ماشینی در کار خود استفاده می کنند. 26 درصد از افرادی که از یادگیری ماشینی استفاده می کنند این کار را به صورت هفتگی انجام می دهند و 20 درصد به صورت ماهانه این کار را انجام می دهند.
• 4 نفر از هر 10 نفری که در نقش سیلیکو کار می کنند، در حال حاضر از ML استفاده می کنند (80٪)، با 68٪ از دانشمندان آزمایشگاه مرطوب در حال حاضر از ML استفاده می کنند.
• پذیرش یادگیری ماشینی قرار است بیشتر افزایش یابد. 82 درصد از کسانی که قبلاً از یادگیری ماشینی در گزارش کار خود استفاده نمی کنند، علاقه مند به انجام این کار در آینده هستند.

مهندسی پروتئین یک اولویت برای توسعه دهندگان زیستی است

• پروتئین ها منطقه اصلی مورد علاقه توسعه دهندگان زیستی هستند. این نظرسنجی نشان داد که 71٪ از پاسخ دهندگان یا در حال حاضر روی مهندسی پروتئین کار می کنند، یا کنجکاو هستند که در آینده آن را کشف کنند.
• مهندسی پروتئین طیف متنوعی از کاربردها را ارائه می دهد. آنزیم‌ها، آنتی‌بادی‌ها، پپتیدهای کوتاه و پروتئین‌های تنظیم‌کننده ژن همگی حوزه‌های مورد علاقه بودند. 53 درصد از مردم به آنزیم ها علاقه مند هستند و 44 درصد می خواهند در 12 ماه آینده روی پروتئین های تنظیم کننده ژن کار کنند.

به‌عنوان کسب‌وکاری که برای آسان‌تر کردن طراحی و ساخت پروتئین‌ها برای زیست‌شناسان تأسیس شد، می‌خواستیم بدانیم که زیست‌شناسان چگونه از فناوری در کار خود استفاده می‌کنند و برای چه چیزی از آن استفاده می‌کنند. دیدن نقش رو به رشدی که کدنویسی و یادگیری ماشینی در زیست شناسی ایفا می کند بسیار شگفت انگیز است و واضح است که دانشمندان پیشرو از این ابزارها برای پیشبرد کار خود استفاده می کنند. با دوره سریع رشد و بلوغ فناوری‌های هوش مصنوعی، به نظر می‌رسد که این امری عادی برای نحوه کار زیست‌شناسان در حرکت رو به جلو باشد.

ما همچنین از تاکید بر طراحی پروتئین شگفت زده شدیم. پروتئین ها این پتانسیل را دارند که ابزاری مرکزی برای مقابله با چالش های بزرگ آینده باشند. از مقابله با تغییرات آب و هوا و آلودگی گرفته تا درمان بیماری ها و تولید منابع جایگزین سازگار با محیط زیست برای غذا، پوشاک، مواد و مواد شیمیایی. دیدن این همه علاقه از سوی توسعه‌دهندگان زیستی در این بخش فوق‌العاده است، زیرا نشان‌دهنده آگاهی روزافزون از پروتئین‌های بالقوه برای حل بسیاری از مهم‌ترین مشکلات جهان است.»

استف ون گریکن، مدیرعامل و یکی از بنیانگذاران، کرادل

Bits in Bio برای فراهم کردن فضایی برای افرادی که در تقاطع نرم افزار و علم ساختمان می کنند ایجاد شده است. بخش مهمی از کار ما جمع‌آوری بازخورد از جامعه در مورد ابزارها و فناوری‌هایی است که روزانه استفاده می‌کنند. با به اشتراک گذاشتن این نتایج به طور گسترده، ما امیدواریم که ارتباط بیشتر بین توسعه دهندگان زیستی در مورد بهترین شیوه ها را تشویق کنیم. واضح است که نرم افزار در حال تبدیل شدن به اهمیت فزاینده ای برای اکتشافات علمی است و ما به دانشمندان و توسعه دهندگان کمک می کنیم تا در این تقاطع هیجان انگیز حرکت کنند.

نیکلاس لاروس استون، خالق بیت ها در بیو و مدیر عامل Sphinx Bio

این وضعیت فناوری زیستی این گزارش بر اساس نظرسنجی از 157 پاسخ دهنده از 18 کشور در سراسر جهان است. این نظرسنجی از 28 نوامبر 2022 تا 5 ژانویه 2023 انجام شد