کاوش در تقاطع زیست شناسی و پروتئومیکس

شما در سانفرانسیسکو مستقر هستید، مرکزی که فرصت های زیادی را فراهم می کند. این چگونه بر توانایی شما برای اینکه یک مربی خوب و یک دانشمند خوب باشید تأثیر می گذارد؟

من عاشق کار در خلیج هستم. این یکی از دلایلی بود که می خواستم به دانشگاه کالیفرنیا سانفرانسیسکو (UCSF) بیایم، زیرا احساس می کنم وقتی به استنفورد رسیدم، این انرژی در منطقه خلیج وجود داشت که در آن احساس می کردم هر چیزی ممکن است. فرد مقابل شما در یک کافی شاپ ممکن است بنیانگذار شرکت بزرگ فناوری بعدی یا یک بیوتکنولوژی فوق العاده باشد که درمان یا تشخیص انقلابی جدیدی دارد.

به دلیل رابطه قوی بین صنعت، دانشگاه و سرمایه خطرپذیر، این مکان عالی برای کارآموزان است تا دانشمند بودن را بیاموزند. مهم نیست که بعداً چه کاری می خواهید انجام دهید، یک فرصت در اینجا وجود دارد.

اعتبار تصویر: Shutterstock / Sergei Drozd

آیا در طیف سنجی جرمی لحظه های “OMG” داشته اید؟

لحظه “OMG” من احتمالاً زمانی بود که اولین کاوشگر شیمیایی خود را ساختم و سلول ها را با آن درمان کردیم، سپس به دنبال این بودیم که ببینیم چه پروتئین هایی روی یک ژل فلورسانس اصلاح شده اند. دیدن چیزی که من به صورت فیزیکی ساخته بودم در سلول ها گنجانده شده و اطلاعاتی به ما می دهد شگفت انگیز بود.

وقتی متوجه شدم که می‌توانیم این نمونه‌ها را به‌گونه‌ای تهیه کنیم که به ما در مورد هویت و چگونگی تغییر چیزها بگوید، بسیار هیجان‌انگیز بود. اینکه بتوانم نمونه‌هایم را به یک مرکز طیف‌سنجی جرمی بفرستم و اطلاعات زیادی در مورد پروتئین‌هایی که در حال اصلاح بودیم به دست بیاورم، بسیار هیجان‌انگیز بود.

امیدوارید از PepSep و PreOmics برای پیشرفت در فناوری های آماده سازی نمونه در 10 تا 15 سال آینده چه چیزی را ببینید؟

کیت های PreOmics شگفت انگیز هستند. آنها اساسا به شما اجازه می دهند نمونه های طیف سنجی جرمی را آماده کنید. اگر می‌توانید DNA را کوچک‌سازی کنید، می‌توانید یک نمونه طیف‌سنجی جرمی با یک نمونه تمیز و با کیفیت بالا تهیه کنید.

آنها کار بزرگی برای ایجاد یک تکنیک در دسترس انجام داده اند. من دوست دارم ببینم آنها نمونه آماده سازی خود را مینیاتوری می کنند تا بتوانیم حتی کمتر آماده شویم. در حال حاضر، ما می توانیم 150 نانوگرم از یک پروتئوم پیچیده را تزریق کنیم و 5000 تا 6000 شناسه پروتئین دریافت کنیم، اما باید حدود یک میکروگرم پروتئین آماده کنیم تا پروتئین کافی را از انجام چند تکرار بازیابی کنیم. من دوست دارم ببینم همه چیز کوچکتر می شود، و فکر می کنم شاید فقط کوچک کردن برخی کارتریج ها لازم باشد.

ستون‌های PepSep از نظر کروماتوگرافی، یک تغییر بزرگ بازی برای ما بوده‌اند. ما آنها را با فشار کمتری اجرا می کنیم زیرا کمی پهن تر هستند، اما جدایی فوق العاده است. قیمت مناسبی دارند و عمر طولانی دارند. ما کانکتورهای سیالیک، لوله ها و قطره چکان ها را بیشتر از ستون های خود تعویض می کنیم.

درباره گوینده

بالین زارو، استادیار دانشگاه کالیفرنیا

میزبان omg OMx: کیت استامپو، مدیر ارشد بازار در بروکر

لینکدین

درباره طیف سنجی جرمی علوم زیستی بروکر

راه‌های جدیدی برای اعمال طیف‌سنجی جرمی در چالش‌های تحلیلی مهم امروزی کشف کنید. نوآوری هایی مانند Trapped Ion Mobility (TIMS)، پرتوهای هوشمند و لیزرهای اسکن برای تصویربرداری MALDI-MS که وفاداری پیکسل واقعی را ارائه می دهند، و فناوری FTMS (XR) با وضوح فوق العاده که قادر به آشکارسازی امضاهای ساختار ظریف ایزوتوپی (IFS) است، کاوش علمی را به ارتفاعات جدیدی سوق می دهد. . راه‌حل‌های طیف‌سنجی جرمی بروکر، دانشمندان را قادر می‌سازد تا اکتشافات مهمی داشته باشند و به بینش‌های عمیق‌تری دست یابند.