استفاده از مجموعه داده های پروتئومیکس برای کشف اهداف درمانی بالقوه برای بیماران سرطانی

دیدگاه پژوهشی جدید در منتشر شد Oncotarget’s جلد 14 در 4 می 2023، با عنوان، “استفاده از داده های پروتئومیکس سرطان برای شناسایی نامزدهای ژن برای هدف گیری درمانی.”

انجمن های سطح ژن به دست آمده از مجموعه داده های پروتئومیکس سرطان مبتنی بر طیف سنجی جرمی منبعی برای شناسایی نامزدهای ژن برای مطالعات عملکردی است. در دیدگاه تحقیقاتی جدید خود، محققان دایانا مونسیوایس، سیدنی ای. پارکس، دارشان اس. چاندراشکار، سوریانارایانا وارامبالی، و چاد جی کریتون از کالج پزشکی بیلور و دانشگاه آلاباما در بیرمنگام در مورد مطالعه اخیر خود بحث کردند که در آن آنها همبستگی پروتئومی درجه تومور را در انواع مختلف سرطان بررسی کردند و پروتئین کینازهای خاصی را شناسایی کردند که تأثیر عملکردی بر سلول های سرطانی آندومتر رحم دارند.

“این مطالعه قبلا منتشر شده تنها یک الگو برای استفاده از مجموعه داده های مولکولی عمومی برای کشف اهداف و رویکردهای درمانی جدید بالقوه برای بیماران سرطانی ارائه می دهد.”

داده‌های پروفایل پروتئومی همراه با داده‌های چند omics مربوط به تومورها و رده‌های سلولی انسانی را می‌توان به روش‌های مختلفی برای اولویت‌بندی ژن‌های مورد علاقه برای بازجویی زیست‌شناسی تجزیه و تحلیل کرد. در میان صدها رده سلول سرطانی، از دست دادن عملکرد CRISPR و امتیازدهی حساسیت دارویی می‌تواند به آسانی با داده‌های پروتئینی برای پیش‌بینی تأثیر عملکردی هر ژن قبل از انجام آزمایش‌های پایه، ادغام شود. پورتال های داده های عمومی داده های پروتئومیک سرطان را برای جامعه پژوهشی قابل دسترس تر می کنند. پلتفرم‌های کشف دارو می‌توانند صدها میلیون مهارکننده مولکول کوچک را برای آنهایی که یک ژن یا مسیر مورد علاقه را هدف قرار می‌دهند، غربالگری کنند.

“در اینجا، ما برخی از منابع ژنومی و پروتئومی عمومی موجود را مورد بحث قرار می‌دهیم در حالی که رویکردهایی را در نظر می‌گیریم که چگونه می‌توان از این منابع برای بینش‌های زیست‌شناسی مولکولی یا کشف دارو استفاده کرد. همچنین اثر مهاری BAY1217389، یک مهارکننده TTK که اخیراً در فاز I بالینی آزمایش شده است را نشان می‌دهیم. آزمایشی برای درمان تومورهای جامد، در مورد زنده ماندن رده سلولی سرطان رحم.”