یک مقاله تحقیقاتی جدید در Oncotarget’s جلد 14 در 12 مه 2023، با عنوان، “توسعه و اجرای یک فرآیند گزارش دهی خودکار و بسیار دقیق برای تست کلونالیته مبتنی بر NGS.”
سلول های B و T قبل از تبدیل شدن به سلول های عملکردی، تحت نوترکیبی تصادفی قسمت های VH/DH/JH جایگاه های ایمونوگلوبولین (سلول B) و گیرنده های سلول T قرار می گیرند. هنگامی که یک بازآرایی VJ در جمعیتی از سلول های B یا T بیش از حد نشان داده می شود که منشا یک سلول را نشان می دهد، این نشان دهنده یک فرآیند کلونال است. کلونالیته به تشخیص و نظارت بر اختلالات لنفوپرولیفراتیو و ارزیابی عود بیماری کمک می کند.
در یک مطالعه جدید، محققان شان تی گلن، فیلیپ ام. گالبو جونیور، جسی دی. لوس، کیرستن ماری مایلز، پراشانت کی سینگ، مانوئل جی. گلینیاس، و کارل موریسون از مرکز جامع سرطان Roswell Park با هدف ایجاد معیارهای عینی، که می‌توانند خودکار شوند، نتایج کلونالیته سلول‌های B و T را به‌عنوان مثبت (کلونال)، بدون شواهد کلونالیته یا نامعتبر (شکست‌خورده) طبقه‌بندی کنند.
با استفاده از نمونه‌های بالینی با داده‌های کلونالیتی «استاندارد طلا» که با استفاده از آزمایش PCR/CE به‌دست آمده بود، سنجش‌های کلونالیته آمپلیکونی مبتنی بر NGS را اجرا کردیم و مدل خود را برای گزارش کلونالیته توسعه دادیم.
محققان برای ارزیابی عملکرد مدل خود، نتایج NGS را در سایر مدل های منتشر شده تجزیه و تحلیل کردند. مدل آنها برای فراخوانی کلونالیته با استفاده از فناوری مبتنی بر NGS، حساسیت سنجش را افزایش می‌دهد و با دقت بیشتری کلونالیته را تشخیص می‌دهد. علاوه بر این، آنها یک خط لوله محاسباتی ساختند تا از مدل خود برای فراخوانی عینی کلونالیته به صورت خودکار استفاده کنند.
“در مجموع نتایج ذکر شده در زیر با تسریع در روند بررسی و خروج از سیستم برای گزارش کلونالیتی مختصر، تاثیر بالینی مستقیم خواهد داشت.”
منبع:
مرجع مجله:
گلن، ST، و همکاران (2023) توسعه و اجرای یک فرآیند گزارش دهی خودکار و بسیار دقیق برای آزمایش کلونالیته مبتنی بر NGS. انکوتارگت. doi.org/10.18632/oncotarget.28429.