نوع جدید XBB از طریق نوترکیبی، پیشی گرفتن از ایمنی و تقویت ذوب زایی قدرت می یابد.

در مطالعه اخیر منتشر شده در مجله ارتباطات طبیعتمحققان ویژگی های ویروسی سندرم حاد تنفسی ویروس کرونا 2 (SARS-CoV-2) نوع XBB را بررسی می کنند.

مطالعه: ویژگی های ویروسی نوع SARS-CoV-2 XBB که از ترکیب مجدد دو زیرمجموعه Omicron به دست آمده است. اعتبار تصویر: Kichigin / Shutterstock.com

نوع XBB چیست؟

در دسامبر 2022، زیر متغیرهای SARS-CoV-2 Omicron تکامل همگرا را تجربه می‌کردند، با جایگزینی‌هایی که در همان باقی مانده‌های پروتئینی سنبله (S) رخ می‌داد. XBB، یک نوع نوترکیب جدید، از آن زمان در کنار تنوع و تکامل همگرای زیرمجموعه های جدید Omicron، مانند BQ.1.1 پدیدار شده است.

اعتقاد بر این است که نوع Omicron XBB از ترکیب دو نسل BA.2، BJ.1، و BM.1.1.1، از نسل BA.2.75 پدید آمده است. مطالعات قبلی ویژگی های ویروسی BQ.1 را توصیف کرده اند. با این حال، ویژگی های XBB نامشخص است.

در مورد مطالعه

در مطالعه حاضر، محققان ویژگی‌های ویروس‌شناسی سارس-کوو-۲ Omicron XBB را با تمرکز بر قابلیت انتقال، میل اتصال آنزیم مبدل آنژیوتانسین ۲ (ACE2) و مقاومت ایمنی بررسی می‌کنند.

سرم های دوران نقاهت از افراد کاملاً واکسینه شده که به عفونت های SARS-CoV-2 BA.2 و BA.5 مبتلا شده بودند، تهیه شد. علاوه بر این، سرم واکسن چهار دوز از افرادی که واکسن دو ظرفیتی BA.1، واکسن تک ظرفیتی و واکسن دو ظرفیتی BA.5 دریافت کرده بودند، به دست آمد. توالی های ویروس از طریق تجزیه و تحلیل توالی یابی ریبونوکلئیک اسید (RNA) ویروسی تایید شد.

حدود 100 توالی تصادفی از هر یک از زیرمتغیرهای Omicron BA.1، BA.2، BA.4 و BA.5، و همچنین 20 توالی تصادفی از BQ.1.1، BA.2.75، BJ.1، و BM بازیابی شد. 0.1.1.1، برای تعیین ارتباط کلی BJ.1 و BM.1.1.1، دودمان اصلی XBB، با سایر انواع Omicron. این توالی‌ها با ژنوم مرجع SARS-CoV-2 Wuhan-Hu-1 مقایسه شدند و به یک هم‌ترازی چند توالی تبدیل شدند.

پویایی اپیدمی مرتبط با دودمان ویروسی با استفاده از داده های نظارت ژنومی ویروسی از پایگاه داده ابتکار جهانی برای به اشتراک گذاری همه داده های آنفلوآنزا (GISAID) تجزیه و تحلیل شد. علاوه بر این، محققان تعداد تولید مثل موثر نسبی (R_ه) برای دودمان های مرتبط با XBB در هند، فراوانی اپیدمی XBB و BQ.1 در هر کشور، و R خاص کشور و جهانی_ه مقادیر دودمان BQ.1 و XBB در کشورهایی که این گونه‌ها سویه‌های غالب در گردش بودند.

نتایج

یک نقطه شکست نوترکیبی منفرد در موقعیت ژنومی 22920 از طریق ارزیابی نوترکیبی قوی از مجموعه توالی‌های هم‌تراز، که برای تمام توالی‌های XBB منحصربه‌فرد بود و با ژنوم مرجع Wuhan-Hu-1 مطابقت داشت، شناسایی شد. مجموعه داده هیچ گونه نوترکیبی را در توالی BJ.1 و BM.1 نشان نداد.

جدیدترین جد مشترک (tMRCA) کلاس XBB در جولای 2022 وجود داشت. با این حال، tMRCA دودمان BJ.1 و XBB در اوایل ژوئن 2022 تاریخ‌گذاری شده است. بنابراین، XBB احتمالاً در تابستان 2022 و زمانی که BM.1.1.1 و BJ.1 دوباره ترکیب شدند، منشا گرفته است.

XBB.1 مقاومت 30 برابری را در برابر سرم های عفونت BA.2 نشان داد. به طور مشابه، جایگزین های V83A، Q183E، Y144del، L368I، R346T، F486S، V445P، و F490S به طور قابل توجهی در برابر سرم های عفونت BA.2 مقاوم بودند.

در حالی که جایگزین‌های فردی تأثیر جزئی بر مقاومت ایمنی دارند، چندین جایگزین در پروتئین XBB.1 S با هم کار می‌کنند تا در برابر ایمنی هومورال ناشی از عفونت BA.2 مقاومت ایجاد کنند. BA.2.75 مقاومت قابل توجهی در برابر سرم های عفونت BA.5 در مقایسه با BA.2 نشان داد. علاوه بر این، XBB.1 با مقاومت قابل توجهی در برابر سرم های عفونت BA.5 همراه بود.

دامنه اتصال به گیرنده XBB.1 S (RBD) تمایل اتصال کمتری به گیرنده ACE2 انسانی در مقایسه با BA.2 S RBD اجدادی داشت. جایگزینی R346T در هر دو XBB.1 و BQ.1.1 میل اتصال BA.2 S RBD به ACE2 را افزایش داد. میل اتصال بهبود یافته XBB.1 S RBD نسبت به BA.2 S RBD به دلیل سه جایگزینی خاص در RBD بود که شامل L368I، R346T و N460K است.

شبه ویروس XBB.1 7.6 برابر عفونی تر از شبه ویروس BA.2 بود، زیرا این RBD ویروسی به دلیل دو جایگزینی R346T و L368I، افزایش قابل توجهی در عفونت کاذب ویروس تجربه کرد.

Y144del، و G252V، که هر دو جایگزینی در دامنه N ترمینال (NTD) هستند، به طور قابل توجهی عفونت کاذب ویروس را کاهش دادند. در مقایسه، جایگزینی V83A در NTD به طور قابل توجهی باعث افزایش عفونت کاذب شد.

نتیجه گیری

XBB تناسب اندام فوق العاده ای را نشان می دهد و در برابر ایمنی هومورال ضد ویروسی ناشی از عفونت های پیشرفت گونه های قبلی Omicron انعطاف پذیر است. بنابراین، گونه‌های محلی SARS-CoV-2 با تناسب اندام بالاتر احتمالاً در سراسر جهان گسترش خواهند یافت، مشابه آنچه در XBB مشاهده شد. این یافته‌ها بر اهمیت تداوم نظارت ژنومی ویروسی برای ارزیابی مستمر خطر انواع جدید SARS-CoV-2 تأکید می‌کنند.