ACMG توصیه های به روز شده ای را برای غربالگری حامل CFTR منتشر می کند

کالج آمریکایی ژنتیک و ژنومیک پزشکی (ACMG) توصیه های به روز شده ای را منتشر کرده است CFTR غربالگری حامل – توصیه های به روز شده برای CFTR غربالگری حامل: بیانیه موضع کالج آمریکایی ژنتیک پزشکی و ژنومیک. انواع بیماری زا در CFTR ژن می تواند باعث فیبروز کیستیک (CF) و همچنین اختلالات مرتبط با CF شود. ACMG به روز شده جدید CFTR لیست انواع شامل مجموعه ای از 100 نوع است.

جدید CFTR فهرست انواع، حداقل مجموعه پیشنهادی به روز شده برای غربالگری حامل CF را نشان می دهد و جایگزین گروه قبلی 23 نفری می شود. CFTR انواع توصیه شده توسط ACMG. این توصیه‌های تجدیدنظر شده برای غربالگری حامل اعمال می‌شود، نوعی آزمایش ژنتیکی که برای تعیین اینکه آیا یک فرد دارای یک نوع ژنتیکی مرتبط با شرایطی است که معمولاً به حضور دو نوع بیماری‌زا نیاز دارد تا یک فنوتیپ را نشان دهد، استفاده می‌شود. این توصیه های تجدید نظر شده در مورد آنها اعمال نمی شود CFTR آزمایش نوع برای تشخیص یا غربالگری نوزاد. تمام جنبه های دیگر ACMG به روز شده 2020 CFTR استانداردهای فنی هنوز اعمال می شود.

“زمانی که در ابتدا توسعه یافت، لیست انواع قبلی استاندارد غربالگری حامل CF را در کشور تعیین کرد. اکنون که پایگاه های داده و فناوری های ما تکامل یافته اند، زمان آن رسیده است که سطح را بالا ببریم و حداقل استاندارد جدیدی را تعیین کنیم. باید به اطمینان از آن کمک کند CFTR جاشوا ال. دیگنان، دکترای FACMG، نویسنده اصلی این مقاله، گفت: «تشخیص گونه‌ها در میان افرادی که نشان دهنده انواع اجداد بیولوژیکی هستند، منصفانه‌تر است.

مجموعه حداقل گونه به روز شده برای غربالگری حامل CF بر اساس شواهدی است که نشان می دهد این گونه به عنوان عامل CF ایجاد شده است و در پایگاه داده تجمع ژنوم (gnomAD)، بزرگترین و پرکاربردترین مجموعه در دسترس عموم از تنوع جمعیت از توالی هماهنگ شده وجود دارد. داده ها. برای این نسخه 2023، یک رویکرد محافظه کارانه با چارچوبی مورد استفاده قرار گرفت که فقط انواع بیماری زا و احتمالی بیماری زا به خوبی تثبیت شده را در بر می گیرد تا نگرانی ها مبنی بر اینکه افراد بر اساس اطلاعات محدود تصمیمات تولید مثلی می گیرند، به حداقل برسد. نسخه‌های آینده این مجموعه حداقل باید امکان و کاربرد ترکیب اطلاعات اضافی از سایر پایگاه‌های داده جمعیتی را مجدداً ارزیابی کنند تا از نظر جغرافیایی تا حد امکان متنوع باشند.

تاریخچه ACMG CFTR توصیه های غربالگری حامل

ACMG مدتهاست که درگیر پرداختن به موضوع بوده است CFTR غربالگری حامل در سال 2001، چندین سازمان حرفه ای به اهمیت و پیشرفت های تکنولوژیکی پیوستند که CF را برای غربالگری ناقلان مبتنی بر جمعیت قابل قبول می کند. با این حال، فناوری و دانش به اندازه کافی پیشرفت نکرده بود که امکان استفاده عادلانه را فراهم کند. فناوری توالی یابی نیز در مراحل اولیه توسعه بود. این غربالگری محدود فقط برای مجموعه‌های کوچکی از انواعی که معمولاً در جمعیت‌های یهودی اشکنازی و شمال اروپا مشخص می‌شوند، اعمال می‌شود. به همین دلیل، در آن زمان توصیه‌ها این بود که غربالگری باید به افرادی که نژاد یهودی اشکنازی و اروپای شمالی دارند «پیشنهاد» شود و در اختیار سایر گروه‌ها قرار گیرد.

ACMG در نهایت مجموعه ای از 25 نوع بیماری زا را توصیه کرد که بعداً به 23 کاهش یافت. برای نشان دادن حداقل مجموعه ای برای غربالگری ناقل همه قومیتی افراد بدون سابقه خانوادگی CF. این حداقل مجموعه (اغلب به عنوان “ACMG-23” نامیده می شود) از آن زمان تاکنون بدون تغییر باقی مانده است، حتی با پیشرفت چشمگیر فناوری های تشخیص مولکولی و دانش ژنتیکی.

توصیه اولیه این امکان را برای آزمایشگاه‌ها فراهم می‌کرد تا یک نسخه توسعه یافته را ارائه دهند CFTR ست واریانت فراتر از مجموعه توصیه شده و در آن زمان، ست های متنوع با برخی بحث و جدل مواجه شد. با این حال، چندین جنبه در حال حاضر تکامل یافته اند، از جمله در دسترس بودن گسترده توالی یابی DNA مقرون به صرفه و کارآمد و همچنین طبقه بندی و تفسیر انواع استانداردتر. در سال 2020، ACMG مجموعه ای به روز شده از استانداردهای فنی را منتشر کرد CFTR تست واریانت که توصیه کرد که آزمایشگاه‌ها اکنون می‌توانند از روش‌های هدفمند یا جامع برای آزمایش استفاده کنند و در آن زمان مجموعه اصلی 23 نوع را به عنوان حداقل مجموعه برای غربالگری حامل CF تأیید کردند.

در سال 2021، ACMG یک منبع عمل بالینی غربالگری حامل جدید را منتشر کرد که در ادامه توصیه می کرد آزمایشاتی را ارائه دهد. CFTR (اکنون همراه با بسیاری از ژن های اضافی) به همه افراد باردار و همچنین کسانی که قصد بارداری دارند.