مطالعه‌ای که اخیراً در مجله بین‌المللی علوم مولکولی منتشر شده است، ژن‌های دارای تغییرات تعداد کپی (CN) را برای شناسایی نشانگرهای زیستی برای پیش‌آگهی سرطان تخمدان (OC) ارزیابی کرد.
مطالعه: AhRR و PPP1R3C: نشانگرهای زیستی پیش آگهی بالقوه برای سرطان سروزی تخمدان. اعتبار تصویر: ESBProfessional/Shutterstock.com
زمینه
OC شامل مجموعه ای از نئوپلاسم های ناهمگن با ویژگی های بیولوژیکی و مورفولوژیکی متمایز است. OC را می توان به انواع I و II طبقه بندی کرد. تومورهای نوع I شامل کارسینوم های موسینوز، سروزی، سلول شفاف و آندومتریوئید هستند، در حالی که بیشتر تومورهای نوع II، کارسینوم های سروزی با درجه بالا هستند.
درمان استاندارد OC کربوپلاتین یا ترکیبی از کربوپلاتین و پاکلیتاکسل است. بواسیزوماب یک درمان نگهدارنده خط دوم است. با وجود این، عود شیمی درمانی پس از خط اول OC به طور مداوم بالا است. فقدان درمان‌های مؤثر به نرخ بالای مرگ‌ومیر و پیش‌آگهی ضعیف در بیماران مبتلا به OC پیشرفته کمک می‌کند.
مکانیسم‌های زیربنای مقاومت شیمیایی به درستی تعریف نشده‌اند، اگرچه مطالعات بر سلول‌های بنیادی سرطانی (CSCs) و مسیرهای سیگنالینگ مختلف دلالت دارند. پیشرفت های تکنولوژیکی منجر به شناسایی بیومارکرهای جدید شده است.
CNA ها به ناهمگنی ژنومی کمک می کنند. اخیراً، تجزیه و تحلیل CNA، امضاهای ژنتیکی را نشان داده است که پیش‌آگهی‌های ضعیف را در انواع سرطان پیش‌بینی می‌کنند.
مطالعه و یافته ها
در مطالعه حاضر، محققان ژن‌های دخیل در افزایش CN در رده‌های سلولی OC و CSCهای تخمدان را برای شناسایی نشانگرهای زیستی پیش آگهی بالقوه OC سروزی ارزیابی کردند. کروی های OC از سه رده سلولی (Ovcar5، Ovcar9 و Caov3) مشتق شدند.
اسفروئیدها بیان بالاتری از نشانگرهای ساقه شناخته شده OC داشتند [aldehyde dehydrogenase 1 (ALDH1), cluster of differentiation 44 (CD44), Nanog homeobox (NANOG), and ATP-binding cassette superfamily G member 2 (ABCG2)].
علاوه بر این، مجموعه ای از تجزیه و تحلیل هیبریداسیون ژنومی مقایسه ای برای مشخص کردن کروی ها و رده های سلولی در سطح ژنومی انجام شد. این تیم ژن‌های دخیل در CNA و مسیرهای مربوط به آنها را بررسی کردند.
تجزیه و تحلیل مسیر کیوتو دایره المعارف ژن ها و ژنوم ها (KEGG) کروی های Caov3، دستاوردهای CN را در ژن های مرتبط با سرطان زایی شیمیایی نشان داد.
قابل ذکر است، رده سلولی Caov3 از دست دادن CN را در ژن‌های مرتبط با مسیر سیگنال دهی O (FoxO) نشان داد. کروی های Ovcar8 دستاوردهای CN را در ژن ها در مسیرهای رگزایی، مهاجرت، بقا، تکثیر و تهاجم نشان دادند.
اسفروئیدهای Ovcar5 عملکرد کمتری نسبت به آنهایی که در مسیر مقاومت دارویی پلاتین بودند نشان دادند، که منجر به تنظیم چرخه سلولی پایین تر و اثر پیش آپوپتوز، مطابق با CSC ها شد.
هیچ یک از کروی ها ژن مشترکی با دستاوردهای CN نداشتند. علاوه بر این، تیم ارتباط بین بیان ژن‌های انتخابی در پیش‌آگهی OC و بقای بیماران را تجزیه و تحلیل کردند.
این نشان داد که یک همبستگی قوی از سرکوبگر گیرنده هیدروکربن آریل (AhRR)، پلی پپتید-N-acetylgalactosaminyltransferase 10 (GALNT10)، و پروتئین فسفاتاز یک زیرواحد تنظیمی 3C (PPP1R3C) با پیش آگهی OC.
تحقیقات بیشتر روی PPP1R3C و AhRR متمرکز شد زیرا نقش GALNT10 در OC قبلاً توضیح داده شده است. برای این منظور، داده های اطلس ژنوم سرطان (TCGA) مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همبستگی هر دو ژن با بقای کلی بیماران معنی دار بود.
علاوه بر این، بیان PPP1R3C و AhRR با نشانگرهای بنیادی CSC همبستگی دارد. علاوه بر این، بیان AhRR یا PPP1R3C بالاتر با بقای بدون پیشرفت بیماران همبستگی منفی داشت.
واکنش زنجیره‌ای پلیمراز بلادرنگ (PCR) افزایش قابل‌توجهی در بیان AhRR در رده‌های سلولی Ovcar5 و Ovcar8 و کروییدها نشان داد اما در Caov3 نه. بیان PPP1R3C تنها در رده سلولی Ovcar5 و کروی ها به طور قابل توجهی افزایش یافت.
این یافته ها به عدم وجود ارتباط بین بیان mRNA و CNA این ژن ها اشاره دارد. علاوه بر این، وجود CNA ها پیش آگهی به نظر نمی رسید.
با این حال، تعداد کمی از زیر جمعیت های CSC بیان بالایی از PPP1R3C و AhRR را حفظ کردند. در نهایت، محققان ارتباط بین بیان این دو ژن و نتایج ضعیف را در بیماران مبتلا به سرطان های دیگر بررسی کردند.
به این ترتیب، افزایش بیان AhRR به طور قابل توجهی با بقای کلی بیمار در چندین سرطان ارتباط دارد. از سوی دیگر، نقش پیش آگهی PPP1R3C بر اساس نوع سرطان متفاوت است.
نتیجه گیری
این مطالعه ژن‌ها را با CNA در سه رده سلولی OC و کروی تجزیه و تحلیل کرد. بیان سه ژن با افزایش CN با بقای کلی بیماران OC همبستگی منفی داشت. بیان AhRR یا PPP1R3C با بیان نشانگرهای بنیادی CSC همبستگی مثبت داشت.
با این حال، هیچ ارتباطی بین دستاوردهای CN این ژن ها و بیان آنها در رده های سلولی OC یا کروی مشاهده نشد. با این وجود، مطالعات بیشتری برای توصیف بهتر نقش این ژن ها در CSC ها مورد نیاز است.